肛瘻最佳時間為肛門內流膿、流血、流水時採取治療。此時需前往醫院檢查治療。

因為患肛瘻以後，瘻管會自動閉合一段時間，患者無任何症狀，此情況可繼續在家觀察，一旦出現流膿、流血、流水的症狀，可在外口注射美藍，若能從肛門內口流出，此時比較容易找到管道。若出現上述情況，則是採取手術的最佳時機。具體用藥請結合臨床，由醫生面診指導為準。