卵巢囊腫主要有生理性囊腫跟巧克力囊腫，生理性囊腫隨著月經期變化，可會自己消退。巧克力囊腫形成原因主要是子宮內膜脫落以後，內膜碎片隨著經血通過輸卵管逆流到盆腔，或者流到卵巢表面、子宮卵巢內部，碎片種植到上述地方以後，隨著身體激素變化，也會脫落、出血，但因為該部位內膜脫落出血以後，排不出去，慢慢陳舊血液積累起來，就形成囊腫。囊腫裡是陳舊性積血，顏色為褐色，像巧克力一樣，比較黏稠，所以稱為巧克力囊腫。隨著日積月累，囊腫會越來越大，越來越嚴重。

巧克力囊腫主要是子宮內膜碎片到卵巢內或者盆腔裡造成，主要是生活環境或者壓力大，尤其夫妻之間做愛頻繁、輸卵管堵塞、分娩、流產等都會造成巧克力囊腫產生，所以日常生活中一定要注意。巧克力囊腫，如果放任不去管，會越積越大，自然破裂，破裂會造成劇烈腹痛，引起麻煩，所以要引起重視。

西醫治療唯一方法是採取手術治療剝離，可能會有後遺症。中醫認為巧克力囊腫主要跟人體氣血有關，氣血虧損、外感風寒溼邪，造成氣滯血瘀。情緒方面，肝氣鬱結也會造成氣滯血瘀，脾胃功能失調痰溼內阻、氣滯血瘀，寒痰停留等，逐漸凝聚成塊，成為巧克力囊腫。