卵巢囊腫的患者可能會感到下腹不適，卵巢囊腫分為生理性囊腫和病理性囊腫，懷孕時因激素水平影響可能會形成生理性黃素化囊腫，隨著懷孕的結束會慢慢消失，孕婦並不會感到腹痛不適。

如果囊腫比較大或者出現卵巢囊腫蒂扭轉可能會出現腹痛，這是婦科比較常見的急腹症，疼痛比較劇烈，還有囊腫是病理性，比如炎性包塊或者子宮內膜異位症的囊腫，本身子宮內膜異位症就伴隨著比較明顯的痛經症狀，隨著包塊長大、病情進展、痛經症狀會越來越明顯。如果B超提示有卵巢囊腫且有下腹不適，可以根據包塊的性質判斷屬於哪一種卵巢囊腫，醫生會根據檢查和查體的情況判斷。