畸胎瘤和卵巢囊腫雖然都在附件區，但是畸胎瘤在B超下呈囊實性的包塊，而囊腫只呈現囊性包塊，這是兩者根本的區別。

畸胎瘤在臨床上，又分為成熟畸胎瘤和未成熟畸胎瘤，主要是根據病理給予診斷的。在臨床上無論是畸胎瘤還是病理性卵巢囊腫，一旦發現建議儘快做手術給予治療。也建議在做手術前抽血檢查婦科腫瘤三項，以便了解是否有惡性病變的可能性。最好在月經乾淨3天至7天不要同房，先去醫院檢查白帶常規。如果沒有病菌感染，可收住院給予手術治療。