並不存在一定能預防子宮內膜異位症復發的方法，但可以通過合理性生活、口服避孕藥、減少宮腔內操作等方式，儘可能降低子宮內膜異位症的複發率。
1、合理性生活：月經來時千萬不要有性生活，因為月經來潮是子宮內膜脫落的時候，如果這時有性生活，容易導致子宮收縮，月經血逆流至輸卵管與盆腔，從而導致子宮內膜種植在盆腔，使子宮內膜異位症復發；
2、口服避孕藥：抑制排卵，可以在醫生指導下口服避孕藥，比如複方左炔諾孕酮片、複方炔諾酮片等，抑制排卵、促進子宮內膜萎縮，可能會幫助降低子宮內膜異位症的複發率；
3、減少宮腔內操作：減少比如宮腔鏡檢查、宮腔手術等宮腔內操作，以免宮腔內出現創面或切口，導致子宮內膜在操作過程中異位。避免做人工流產手術或者診斷性刮宮等手術，因為此類手術會損傷到子宮內膜，引起復發。
另外，子宮內膜異位手術以後一定注意儘量多下床活動，防止盆腔裡面的腸粘連、子宮內膜異位的復發。定期鍛鍊，增強身體素質，例如跑步、游泳、跳繩、瑜伽、太極拳等運動，可以促進增強身體素質、提高身體免疫力，可能會幫助降低子宮內膜異位症的複發率。
還要定期體檢，例如白帶常規、陰道鏡、陰道B超等，可以及早發現並及時治療，也可以起到輔助預防子宮內膜異位症復發的作用。