蒙脫石散屬於止瀉藥，可通過收斂作用吸收水分並吸附腸道內細菌與毒素，從而起到止瀉作用。但它對緩解腹痛的作用有限，通常不存在明顯緩解腹痛的作用。蒙脫石散常用於急性腹瀉的患者，尤其是病毒感染引起的腹瀉。當患者腹瀉次數較多、大量稀便時，使用蒙脫石散可以有效減少大便次數，防止出現脫水等症狀。

若屬於細菌感染引起的腹瀉，腹瀉時可能將體內的有害菌排出，而過度止瀉可能會導致疾病加重，出現腹脹、發熱等症狀。若炎症性腸病的患者出現腹瀉且較為嚴重的情況下，應進行對因治療而並非使用蒙脫石散。若炎症性腸病的患者在急性期大量使用蒙脫石散，可能會誘導腸道蠕動減慢，可能會誘發中毒性巨結腸。