ERCP是非常安全的手術，但也有一定的併發症，最常見的是急性胰腺炎，發生率大概在5%-10%。因為做選擇性膽管插管時，熱損傷會對胰管有一定干擾。另外，術中胰管意外顯影也會導致胰腺炎。預防措施主要如下：

1、術前使用消炎痛栓劑，可一定程度上降低胰腺炎的發生率；

2、術中輕柔操作，儘量避免胰管顯影；

3、用導絲介入法減少對胰管的干擾，也可降低發生率。一旦進入胰管，必要時可以置入胰管支架；

4、膽道疾病治療後置入鼻膽管，在一定程度上可預防術後胰腺炎的發生；

5、術後禁食和預防性應用生長抑素也是預防術後胰腺炎發生的一種措施。