滴蟲性包皮龜頭炎因為診斷比較明確，一般用甲硝唑足療程治療1-2周就會痊癒。
最好能夠再做清潔，因為吃進去的藥可能把滴蟲殺死了，但內衣、皮膚上的一些細菌有可能沒殺乾淨，所以可以將藥物磨成粉或用中藥泡洗患病區域，這樣就可以解決問題，一般1-2周就可以痊癒。
患者如果有性夥伴或已經結婚，需要對方同時進行治療，不然很容易再感染。