非淋是衣原體和支原體的感染，衣原體和支原體是細胞內寄生的微生物，引起的疾病範圍較廣泛，可以引起尿道、生殖道、眼以及其他等多個器官的損傷。男性可引起的疾病包括尿道炎，如尿道有分泌物、附睪炎、睪丸部位的疼痛和前列腺炎以及關節炎，甚至Reiter綜合徵，除引起關節炎症狀外，還可以引起全身皮疹的表現；女性可引起的疾病包括尿道炎、宮頸炎、盆腔炎，甚至可以引起肝臟周圍炎、急性的輸卵管炎，繼發引起不孕不育，特別是流產後熱，還可引起月經的異常，意外的流產等。