若想要診斷前列腺癌而進行前列腺活檢穿刺，通常風險較低。在醫療技術尚未完善時，前列腺活檢穿刺均在門診進行，但患者可能會發生感染而出現膿毒血癥，危及患者的生命。尤其懷疑前列腺癌的患者多數為老年人，抵抗力較低，如果發生感染，會出現較嚴重的風險。

因此，目前多數醫院在進行前列腺癌穿刺活檢時，會將患者收入院後進行充分的術前準備，將直腸內的糞便及細菌清理後再進行穿刺。術後還需短時間給患者應用抗生素，從而預防感染併發症的發生。此外，個別患者可能會發生嚴重出血，但在臨床中較為少見。