寶寶生理性腹瀉一般是由於兒童消化系統發育不完善，腸道的正常菌群沒有建立、餵養不當，或受到母乳成分影響所造成，治療上可分為以下兩方面：

1、調整餵養方式：如減少食物中的乳糖含量，可選擇豆乳或無糖奶粉替代母乳，也可添加輔食增加營養，待症狀好轉後逐漸恢復母乳餵養，保證足夠營養攝入，以免影響生長發育；

2、調整母親飲食：如攝入過多脂肪、蛋白質等會引起寶寶生理性腹瀉，建議減少高蛋白、高脂肪的食物攝入，避免進食生冷刺激的食物，可多食用富含纖維素的水果、蔬菜，如蘋果、芹菜等，保持心情舒暢，避免上火等。

出現生理性腹瀉以後，通過上述治療多可慢慢好轉。如症狀未見好轉，可遵醫囑應用益生菌類藥物，如雙歧桿菌調節腸道菌群，腸黏膜保護劑蒙脫石散維持腸道功能，助消化藥多酶片改善消化功能等。

此外，日常應加強護理，及時換尿布，用溫水清洗臀部及會陰部，並用鞣痠軟膏等塗抹，以免引起臀部皮膚髮紅，造成局部感染。如大便次數突然增加，大便內水分增多，有臭味，則要警惕病理性腹瀉的發生，應去醫院檢查，並且積極治療。