女性尿道口疼，最常見原因是泌尿道感染，與女性特殊的生理結構有關。因為女性尿道的特點是短、寬、直，並且尿道和陰道、肛門之間的距離非常的近，肛門、陰道附近的細菌，容易通過尿道而進入到膀胱，從而引起感染。同時，月經期以及性生活的特點，也決定了女性容易出現尿路感染。

除此之外，尿道肉阜或者是尿道癌，也會引起尿道口的疼痛、破潰、出血，需要患者進行詳細的體格檢查來幫助診斷。