泌尿系統結核主要根據結核進展情況選擇合理治療，具體治療如下：

1、藥物治療：目前最常用的藥物是利福平、雷米封、吡嗪酰胺等。通過此類藥物組合達到控制結核的目的，通常治療週期為6-9個月。而通過抗結核治療達到治癒結核並保存腎臟的目的，僅適用於極早期的腎結核。因此臨床上通過抗結核治療，達到保腎目的的機會並不多。結核早期症狀較隱匿，等明確診斷後，通常已達到一定進展；

2、手術治療：腎結核發生後要進行評估，手術治療前進行抗結核的處理。通過2周以上的抗結核治療後，再進行腎臟的切除手術。還應對結核所引起的併發問題進行處理，臨床上最常見的併發問題為攣縮膀胱，患者會出現嚴重的尿頻、尿急。此時可以根據情況選擇膀胱擴大手術，改善排尿的刺激症狀。