小兒泌尿系統結核感染，會出現尿路刺激症狀，即尿頻、尿急、尿痛等症狀。還可出現膿尿，尿液有膿球細胞，且尿液非常黏稠或尿裡存在較多白色混濁物。患兒還可出現發燒，主要以低熱為主，甚至出現膀胱攣縮、肉眼血尿等。

如患兒有泌尿系統結石，反覆肉眼血尿，但尿培養結核桿菌呈陽性，尿培養是陰性，需做結核相關檢查，結合B超、影像學檢查以明確診斷。