膀胱結石的治療大部分考慮膀胱結石形成的原因，在早期中國的發病情況，膀胱結石是原發的，多數跟營養狀況有關，但隨著目前經濟的改善，膀胱結石多數是繼發於前列腺而發生的疾病。

針對膀胱結石的治療首先的治療原則是以去除結石為第一目的，同時第二要針對病因的治療。針對膀胱結石的處理過程中選擇的手術方式目前是以微創技術為主的手段，手術包括從尿道進去膀胱碎石取石，同時經過尿道把引起膀胱結石的前列腺增生處理掉。處理膀胱結石在病情許可、病人身體耐受的情況下，需要同時做兩個手術來解決。