輸尿管結石來源於腎結石，腎結石向外移出形成輸尿管結石，腎和輸尿管結石統稱為上尿路結石。結石發生的原因非常複雜，主要原因是來自於尿液有形成分析出，即結晶。結石成分含晶體和基質兩大部分，其中晶體是主要部分，佔97%，而基質只佔3%。根據晶體的不同，把結石分為含鈣結石、感染性結石、胱氨酸結石和尿酸結石，同一種結石可以是單一成分，也可以是複合成分。結石成因非常複雜，目前具體發病機制尚不清楚，根據推測將病因分為四個層面：

1、外界因素：包括自然環境、天氣等；

2、個體因素：包括個人膳食、嗜好以及基礎疾病等；

3、泌尿系統問題：包括泌尿系統是否存在感染，是否存在有梗阻等問題；

4、尿液的成石因素。

結石的發生是在外界因素、個體因素和泌尿系統因素的共同作用下，導致尿液的成石因素髮生改變，尿液中的有形成分析出形成結晶，進一步發展形成結石。