自閉症的判斷，需要臨床醫生綜合考慮疾病的病程標準、症狀學標準、嚴重程度標準和排除標準，最終考慮確定。

主要的症狀是：自閉症多起病嬰幼兒期，存在持續的社會交往障礙、語言發育遲緩、興趣範圍狹窄和刻板重複的行為模式。如果能夠排除兒童精神分裂症、智力障礙和其他廣泛性發育障礙，可以考慮是自閉症。在臨床上，除了對孩子進行觀察，與孩子進行交流之外，家人提供的病史非常重要。

還有一些臨床量表的使用，也能夠有助於自閉症的診斷，而且還能夠了解自閉症症狀的嚴重程度，並且對自閉症治療前後的效果進行評估。常用的評估量表有，孤獨症譜系障礙行為評定量表、孤獨症譜系障礙評定量表、克氏孤獨症譜系障礙行為量表、孤獨症診斷觀察量表、孤獨症診斷訪談量表修訂版等。