通常反流性食管炎可以引起咽炎，為咽炎的常見病因。反流性食管炎，由於胃腸功能紊亂造成胃酸分泌旺盛、胃內容物及胃酸反流，引起食管炎，同時胃內容物及胃酸，通過食管上端，引起咽喉部刺激，造成咽喉部的黏膜充血、水腫，而出現反流性咽炎，患者表現為咽乾、咽痛、噁心、燒灼感，以及聲音嘶啞等。

檢查可以發現，淋巴濾泡增生，間接喉鏡或電子喉鏡檢查，可以發現杓狀會厭襞黏膜充血、水腫，多為反流性咽炎的典型體徵。在治療上，除積極治療咽炎之外，患者要配合抑酸治療，其病程較長，通常要採用8-12周的用藥，並配合促胃腸動力藥物，以及保護胃黏膜的藥物，才有較明顯的臨床效果。