80％-90％的反流性食管炎會好。對於部分反流性食管炎患者，可在內鏡下發現食管糜爛且會出現燒心、反酸、反流等症狀，但通過正規服用藥物，尤其是質子泵抑制劑等，食管糜爛的癒合率在80％-90％，但無法明確保證疾病不會復發。反流性食管炎與多種原因有關，包括飲食、生活習慣、精神壓力及情緒等。對於停藥後症狀是否會復發，需根據誘因是否能夠去除決定。

若未將病因去除，導致停藥後症狀反覆發作，建議患者進行維持治療。維持的時間及藥物劑量因人而異，應根據不同的方案進行治療。反流性食管炎的治療目標是緩解症狀，保護食管不被胃酸侵襲。即使症狀有所反覆，只要食管糜爛在保護下則不會引起嚴重疾病，患者無需過於擔心。