反流性食管炎有一部分人會引起咳嗽，一般是由於胃、十二指腸內容物反流刺激食道、氣道引起，所以單純用止咳藥效果相對較差。因此，治療反流引起的咳嗽要先治療胃食管病，具體如下：

1、生活方式改善：是一切其它治療的基礎，戒菸、戒酒，避免進食高脂肪、咖啡、巧克力、辛辣刺激、油膩食物，睡前3小時不要吃東西，睡覺時抬高床頭15-20cm，白天進食後避免立即平臥。對肥胖或超重患者，建議控制體重，保持合理體重；

2、藥物治療：主要是抑酸劑、促動力劑和胃黏膜保護劑，抑酸劑有質子泵抑制劑、H2受體拮抗劑，促動力藥有莫沙必利等；

3、如果藥物治療效果不好，可能需要內鏡下治療。