幼兒川崎病是否要終生複查取決於患者的病變嚴重程度。川崎病為自限性疾病，若患者病變沒有累及冠狀動脈系統，在其出院後的1個月、3個月、半年、1年、2年分別進行一次複查，複查未見異常後可考慮治癒，無需繼續複查。

若患者併發冠狀動脈瘤，需長期密切複查隨訪，直至冠狀動脈瘤消失。有的病人併發血栓形成，可能需要抗凝治療，此類患者可能需要終生複查，監測凝血指標及心功能等。