幼兒川崎病患者出院後，對於沒有冠狀動脈病變的患兒需要於出院後第1、3、6個月、以及1到2年進行一次全面檢查，包括體格檢查、心電圖和超聲心動圖等。

沒有經過有效治療的患兒，有10%到20%的可能會發生冠狀動脈病變，應該長期隨訪，每6到12個月隨訪一次。冠狀動脈擴張或者是冠狀動脈瘤大部分於病後2年以內自行消失，但是經常會遺留管壁增厚或者是彈性的減弱。