由於引起水腫的原因非常多，每一種病因所引起的水腫治療方法各不相同，無法有統一的治療方式。但水腫治療的基本原則都是，根據病人情況對症治療，治療病因消除水腫，維持生命體徵穩定。比如心源性水腫一旦診斷明確應該治療心衰，心衰控制好後水腫自然消退。肝性水腫，若為乙肝、肝硬化引起，則大部分是低蛋白血癥引起的水腫。這時候就需要抗肝硬化治療、抗病毒治療、護肝、營養支持、治療腹水等。
腎源性水腫原因也較多，主要也是對應治療。若為腎病則可以用糖皮質激素，免疫抑制劑等治療，腎病控制後水腫自然消退。若為血管性疾病引起，比如布加綜合徵，下肢靜脈血栓等。則需要解除下腔靜脈阻塞或者下肢靜脈血栓。其餘病因所致的水腫也都需要遵循治療原發疾病，維持生命體徵的基本原則。