患者肛瘻掛線術後，掛線期間分泌物比較多。掛線主要是慢性切割括約肌，以及引流出瘻管內的髒東西，因此會有較多的比較臭的分泌物流出。20天患者拆線以後，創口生長比較快，填充肉芽開始爬皮，因此拆線後，患者可能有1-2周還會存在分泌物。在完全爬皮以前都會存在分泌物，因此分泌物的持續時間大概得4-6周，患者不必緊張、害怕。

分泌物是比較正常的東西，掛線時分泌較多，但拆線後分泌物會越來越少，隨著創口癒合、爬皮增進，分泌物會逐漸減少，直到封口以後，分泌物會逐漸消失。但是有時傷口剛完全癒合，可能存在瘢痕溝，部分患者會有腸液流出，待瘢痕軟化，肛門閉合後，腸液不會再流出。