肛瘻是否容易復發需要根據肛瘻位置高低、病情複雜程度決定，通常低位單純性、低位複雜性肛瘻手術以後不會復發，高位肛瘻存在復發可能性。高位複雜肛瘻位置較深，盲端位置較高，治療主要是依次治癒和保護肛門括約功能之間的關係，保護肛門括約的功能不受較大影響，因此存在一次手術不能治癒的可能性。高位複雜肛瘻需要採取引流通暢切開掛線，術後定期換藥，有利於創面恢復，因術後複發率較高，術後需要注意保持局部衛生，定期換藥。

肛瘻分單純性肛瘻和複雜性肛瘻，相對於單純性肛瘻複雜性肛瘻復發幾率更高，特別是高位複雜性肛瘻。因為複雜性肛瘻有兩個或兩個以上內口或外口或管道較多，內口位置不確定，瘻管走行復雜錯綜。無論是內科還是外科手術治療瘻管都容易切除不徹底，引起術後復發。單純性肛瘻因為只有一個內口和瘻管，無論切除、切開還是掛線術後複發率較低。通常術後需要多休息，注意傷口衛生，短期內避免進食容易上火、刺激性、海鮮類食物。平時需要做好預防工作，養成良好飲食習慣，忌吃辛辣、寒涼、油膩食物、忌菸、忌酒。養成良好排便習慣，排便時避免過度用力，排便時間避免過長，嚴格注意個人肛門衛生，每天清洗可以減少復發幾率。