肛瘻手術後7-10天存在較多分泌物，為炎性滲出並非排膿，通常肛瘻術後隨肉芽組織增生、生長，創面癒合後滲出液或分泌物，可逐漸減少甚至消失。手術以後一般7天內創面屬於炎症水腫期，流出分泌物較多，7-10天后炎性滲出相對較少，創面可能存在組織水腫，部分分泌物有利於創面癒合。

傷口局部有感染性物質存在時可以及時清除分泌物，有利於傷口癒合、新鮮肉芽組織生長。肛瘻術後應適當保持創面清潔，經常應用中藥坐浴燻洗可改善肛周微循環、促進肉芽組織生長、促進創面癒合。術後3-4周創面可以基本癒合，在此期間需要保持肛門局部衛生，預防感染，可以每天用碘伏進行消毒，同時塗抹藥膏防止炎症發生。