肛瘻手術以後當天需要臥床休息，第2天可以下床活動、走路，但肛瘻術後早期應避免多走動，以臥床休息為主。因為早期過多行走可摩擦到手術刀口，導致切口出血、疼痛，對刀口癒合造成一定影響。因此肛瘻手術以後需要適當活動，促進手術創面壞死組織的引流和排出，避免分泌物附著在創面，同時保持手術創面引流通暢。術後1周患者可以適當增加運動量，適當活動可以加速局部血液循環，促進肛瘻手術切口內的肉芽生長，加速切口癒合。同時可以加速腸道蠕動，防止患者術後形成便秘或大便乾燥等症狀。

肛瘻手術切口完全癒合後不影響正常行走，但需要防止劇烈運動，如跑步、打羽毛，通常手術刀口癒合後1-2個月再進行此類活動。肛瘻手術以後1個月可基本癒合，癒合以後可以恢復正常工作和生活，術後3個月內應該禁止騎自行車等劇烈運動，因為新鮮癒合的刀口組織較脆弱，騎車摩擦可導致局部破損感染。因此肛瘻術後患者早期應該避免多走路，後期應該避免劇烈運動。