肛瘻手術治療需要住院。肛瘻屬於肛周膿腫自行破潰或人為切開後的後移管道，在肛門周圍存在潰口，潰口可以流膿、流血，發作時疼痛伴肛周膿腫。肛瘻手術主要將肛瘻內口、外口、瘻管完全切除，使創面開放引流通暢以利於創面癒合，最後達到完全治癒目的。手術方式根據瘻管高低、瘻口數量採用不同方式，高位肛瘻可以採用掛線療法，低位肛瘻通常將瘻管直接切除。因此肛瘻手術較為複雜，手術過程和手術時間較長，需要打麻醉才能進行。

麻醉種類較多，包括腰硬聯合、骶管麻醉，骶管麻醉需要由麻醉醫師進行操作，否則麻醉過程很難保證安全，可能出現危險。明確診斷肛瘻以後需要通過住院手術方法進行治療，手術後肛瘻完全恢復時間大約需要1個月，在此期間堅持換藥，主要目的是保持肛瘻創面引流通暢，防止肛瘻發生橋形癒合，防止因為引流不通暢導致再次復發。因此手術以後換藥較為重要，同時需要注意保持局部清潔和衛生。