簡單肛瘻可能會出現反覆感染，表現為局部紅、腫、熱、痛，排便時疼痛加重。嚴重肛瘻如果位置較深，可能會造成肛門括約肌功能障礙，出現大便失禁，瘻道蔓延至膀胱會形成直腸膀胱瘻。女性患者可能會影響到陰道形成直腸陰道瘻，治療不及時，可能導致外口阻塞引發膿液積聚、排便不暢，引發新痔管。

當發現肛瘻，建議及時到專科醫院進行相關檢查，如果不行手術治療，可以暫時控制感染，減輕症狀。需養成正確飲食習慣，飲食清淡，多食用富含維生素食物，例如新鮮蔬菜、水果等；忌食辛辣、刺激、油膩等食物，例如辣椒、大蒜等，少飲酒。養成良好排便習慣，每天定時大便，保持大便通暢，避免排便時間過長，防止便秘或腹瀉，排便後可沖洗或坐浴保持肛門清潔。手術為根治肛瘻主要的手段，可以清除感染組織並將瘻管及感染異物清除。