預防肛瘻主要從以下三個方面來著手：

1、注意防治引起肛竇感染的疾病，例如防治肛裂、腸炎、便秘等疾病，及時治療肛竇炎和肛乳頭炎，以避免發展形成肛周膿腫和肛瘻；

2、注意飲食，飲食起居應該多進食清淡、富含有纖維素食物，減少飲酒或戒酒，少進食辛辣刺激或炙烤、油炸食物；

3、養成良好生活習慣，例如避免久坐、避免久蹲，養成定時排便習慣，在大便時候避免蹲太久，避免看書、看報和看手機等故意延長排便時間習慣，大便後需要用乾淨、柔軟手紙輕輕擦拭肛門，然後用溫水洗淨肛門，條件許可的情況下最好每天能夠用溫水或冷水坐浴，能夠保持肛門清潔衛生。對於存在久坐久站職業人群需要經常變換體位，抽空活動活動下肢、腰部，儘量抬高下肢以促進血液迴流。另外應該經常參加體育鍛煉，經常進行體操、游泳、跑步、跳舞等運動，對全身血液循環、肌肉功能加強會有明顯促進作用，體質加強後機體抗病能力也提高，可以有效防止肛瘻發生。