肛瘻手術後患者都比較急切，做了手術都希望儘快恢復。但肛瘻手術以後創面恢復需要經過幾個時期，肛瘻手術後前1-2天存在傷口滲出期，滲出期是傷口內膿液和血性分泌物的排洩過程，長短不一。如果是深部肛瘻，排洩期可以在一週，小的肛瘻1-2天可以排淨。當傷口膿液排淨，傷口則開始癒合。

開始癒合過程也是一個緩慢過程，不能過急，因為傷口創面癒合有其規律，一般3-7天是排洩期，七天以後肉芽組織開始填補、增生。這種情況下還需要醫生不斷換藥，觀察肉芽組織的生長是否健康。如果看到肉芽組織水腫或過度增長時，醫生還要對傷口進行較小處理。只有較好維護傷口狀態，肛瘻傷口才能在15-20天左右徹底癒合，而快速癒合與醫生和患者的配合無法分開。