一般治療矮小症的最佳年齡在3-12歲。但是由於造成矮小症的原因不同，治療的時機和方法也都有所不同，但一般不建議超過12歲，因為12歲以後，骨骺線可能會閉合，閉合後即使再進行治療，也無法再有明顯長個的情況出現。

1、甲狀腺功能減退：如果矮小症是由於甲狀腺功能減退而引起，發現的同時應立即進行治療，在日常生活中，還應該多吃碘劑以及加碘鹽，因為甲狀腺功能減退還可能會影響大腦的智力發育，所以發現後應立即治療；

2、生長激素缺乏：如果矮小症是因為生長激素缺乏的原因而導致，可以不必過早的進行治療，因為在3歲前很難判斷是否由於生長激素缺乏而引起。如果確診生長激素缺乏，在3-12歲都可以通過打生長激素的方法進行治療。

矮小症還可能受營養、環境等因素的影響，最佳的治療時間也需要根據具體病因來決定，並且在治療矮小症的同時，還應該注意心理治療，因為身材矮小可能會遭到周圍同學、朋友的歧視，要適當的安撫患者，以免出現自卑等心理。在日常生活中還應該增加鈣的攝入，平時多曬太陽，促進鈣的吸收。可以適當的做一些體育運動，例如跳遠、打籃球等，刺激骨骼的生長發育。