肛門有膿液流出，一般會在以下幾種疾病中可出現：

1、結直腸的炎性疾病，比如結直腸炎、克羅恩疾病等都可以導致肛門有膿液滲出；

2、肛門周圍的感染性疾病，包括肛周膿腫、肛瘻或者是肛竇炎，也可以引起肛門周圍有膿液滲出，以上兩種最常見。根據不同的疾病，需要選擇不同的治療。一般發現膿液提示身體出現了感染的症狀、感染性疾病，針對不同的部位的感染，需要選擇不同的治療方法，比如肛門直腸的炎症、結直腸的炎症出現膿性的分泌物，需要通過灌腸或者是口服藥物的治療來消除疾病，從而使膿液消失。如果是由於肛門周圍膿腫或者是肛瘻引起膿性分泌物，這類疾病往往非手術治療效果不好，在這種情況下，需要藉助手術治療來消除病灶，達到治療疾病的目的，最終使肛門膿液消失。