肝臟手術最大的就是換肝，整個肝臟都換。肝移植手術以後可能會出現很多併發症，肝移植早期併發症，換肝時裡面有很多接口，如接血管、接膽管，如果接的血管比較細小，可能會造成狹窄，造成肝血供不足，或肝膽管狹窄，這些都可能會造成近期併發症，還會有出血。

遠期併發症是移植的肝可能不成功，雖然肝移植成功，但是沒有功能，也可能是因為缺血原因造成。還有重要的併發症就是免疫排斥反應，即移植的肝和原來很多免疫指標，發生免疫排斥反應。現在已經有很多藥可以調整免疫功能，抑制免疫排斥反應，多數可以控制，但是有少數會造成肝沒有功能。如原來是肝癌患者，移植以後過幾年，特別容易再長肝癌，也算是遠期的一種併發症。