肝移植術後包括近期併發症和遠期併發症問題，近期併發症包括腹腔內出血，即術中、術後大出血。還有包括移植肝動脈血栓或移植中肝動脈破裂，門靜脈血栓和腔靜脈狹窄或腔靜脈出血，主要涉及出血與血栓問題，屬於近期併發症。近期併發症，因為急性排斥反應引起膽道損害；長期併發症，因為患者長期服用免疫抑制劑，可能發生免疫抑制劑相關副作用，如感染或肝功能損害以及慢性排斥反應，出現膽道併發症等。其它併發症也較多。