嚴重燒傷合併真菌感染的治療方法如下：

1、加強創面換藥、清潔創面，必要時進行手術清創，去除真菌感染的創面，並用乾淨、清潔、促進癒合及抗菌的敷料覆蓋創面；

2、嚴重燒傷合併真菌感染可能是創面合併真菌感染、大量應用抗生素的過程中引起二次感染、胃腸系統感染，所以在全身情況允許的條件下使用抗真菌藥物進行治療，具體藥物則包括大扶康、卡泊芬淨。