甲狀腺囊腫一般不嚴重，但囊腫較大可能產生一定壓迫症狀。由於甲狀腺位於頸前部，腫物較大時可能產生呼吸和吞嚥困難，影響患者日常生活。甲狀腺腫大非常明顯，甚至影響患者美觀也為手術指徵。甲狀腺囊腫臨床上較為多見，如結節性甲狀腺腫伴出血或直接形成的甲狀腺囊腫。儘管大多甲狀腺囊腫屬於良性病變，腫物較大產生一定壓迫症狀或影響患者頸部美觀，均需進行手術切除。

由於甲狀腺囊腫相對較大，定位相對較容易，手術大多為較簡單操作，因此有時手術半個小時即可完成。出現甲狀腺囊腫時，及時到醫院就診，通過超聲、CT等檢查對囊腫性質作出判斷。如果產生壓迫或影響美觀，應積極進行手術切除，大多數可得到較好的治療效果。