甲狀腺囊腫是指在甲狀腺裡看到完整包裹的液性結構，部分也有實性結構，有些是囊實性並存的結構。如果腫瘤生長較快，裡面可產生壞死。還可以因為囊內的出血，比如腫瘤局部血管較豐富，血管破裂之後可導致血流進入到周邊的區域，包裹之後形成囊腫。當囊腫的壓力和血管內壓達到平衡的時候出血停止，這樣形成靜止共存的狀態。通常囊腫是良性改變而不需要特殊的治療，但是如果囊腫增大產生壓迫症狀。甲狀腺囊腫的治療與甲狀腺良性腫瘤的治療一致，如果有臨床的壓迫症狀，壓迫氣道、食道甚至壓迫喉返神經時，此為外科手術治療的指徵。