隨著醫學影像學、分子病理學、微創診治理念及靶向藥物的不斷變革，人們對於胃腸道間質瘤的發病機制和診斷治療，都有了全新的認識。胃腸道間質瘤的規範化治療是針對胃腸道間質瘤的大小、部位、生長方式、影像學表現，以及基因檢測結果、患者不同的病情來採取，包括外科手術和靶向藥物相結合的個體化治療策略。

胃腸道間質瘤並不是一經發現就要馬上切除，醫生會根據腫瘤的位置、病理特點進行綜合評估，決定是否需要手術切除。如果需要手術，醫生也會根據患者的腫瘤情況和自身條件來選擇手術的方式進行個體化治療，通常手術方式包括傳統的開腹手術、腹腔鏡微創手術、機器人微創手術、內鏡治療等。靶向藥物治療包括一線藥物伊馬替尼、二線藥物舒尼替尼、三線藥物瑞戈非尼和四線藥物瑞派替尼。

隨著臨床專業的不斷細分，各學科間的溝通和協作顯得越來越重要，多學科團隊協作的診治模式，即MDT應運而生。MDT診療模式不僅有助於判斷胃腸道間質瘤患者的手術指徵，制訂安全可行的手術方案，也能提升患者術後康復，制訂靶向藥物治療方案，及隨訪等科學有效性，使患者充分獲益。因此對於病情複雜、瘤體巨大，或位置特殊的胃腸道間質瘤患者，建議到病例比較多的診療中心MDT就診，以實現規範化和個體化的治療。