兒童的手足口病主要是腸道病毒71型（EV71）和柯薩奇病毒A16型引起。感染以後引起小朋友的手、足、口、臀部出現斑丘疹和皰疹，口腔內皰疹常破潰形成潰瘍，通常在吃東西時會出現疼痛。

兒童的手足口病潛伏期大概是在2-7天，可發熱或不伴發熱，多有咳嗽、流涕、頭痛、食慾不振等非特異性症狀。皮疹不留瘢痕或色素沉著。