手足口病疫苗在一定程度上是管用的，但疫苗不可能包羅萬象，並不是手足口病所有種類的病毒都能對付。由於導致手足口病的病毒很多，疫苗僅僅是對針對某一種病毒，如果注射了手足口病毒的疫苗，即可以起效。

如果針對某一種病毒，注射疫苗以後產生足夠抗體，以後獲得這一種病毒導致的手足口病的抗體，病毒基本上不會換，但是對疫苗病毒無關的其它病毒可能無效。因此手足口病毒疫苗的預防，要一分為二來講，總體來說，注射了疫苗應該是有用的。