一般利巴韋林治療手足口病不管用，因為引起兒童發生手足口病的病毒是腸道病毒。

腸道病毒主要包括柯薩基病毒或者EV71病毒，這些病毒會引起兒童出現手足口病，從而表現為手、足、口甚至臀部的皰疹，需要應用清熱解毒的中成藥處理，比如可以應用藍芩口服液、蒲地藍消炎口服液等等。而利巴韋林對於這些腸道病毒效果微乎其微，並且利巴韋林往往會引起兒童出現副作用，比如會引起肝、腎功能損傷甚至會引起細胞發生畸變等。