新生兒反覆肺炎的原因主要是免疫系統、免疫器官發育不成熟，抵抗力相對成人和兒童較低下。影響新生兒免疫狀態的主要有以下幾個因素：

1、分娩方式：陰道分娩的新生兒免疫力一般好發於剖腹產的新生兒；

2、餵養方式：母乳餵養的新生兒免疫力較人工餵養的新生兒免疫力強；

3、是否足月：早產兒免疫系統發育更加不成熟，更容易發生感染；

4、腸道微生物：腸道微生物菌群的建立有助於兒童免疫系統的建立，可以給予兒童適當口服益生菌，幫助建立腸道微生物菌群。