性功能障礙檢查、治療費用根據病情而定，功能性障礙，檢查和治療費用大概幾百到幾千元。

特殊因素、器質性的疾病，或者因腫瘤所導致的性功能障礙，需做CT或MR等進一步檢查時，費用大概超過千元。

包莖、包皮過長而導致的功能性障礙的進行包皮環扎術，費用大概為兩千元，器質性功能障礙手術，例如陰莖假體植入，手術費用大概為幾萬到十多萬。