在臨床上，新生兒急性呼吸窘迫綜合徵屬於極危重症，因為新生兒急性呼吸窘迫綜合徵易造成低氧血癥。如果患兒呼吸不佳，發生低氧血癥，低氧血癥會造成新生兒，包括小嬰兒的各個臟器嚴重缺氧。缺氧之後患兒容易併發肺動脈高壓，肺動脈高壓亦可持續地加重缺氧，患兒可出現頑固性的低氧血癥，最終可造成肺出血。肺出血之後，患兒不僅可出現貧血與多臟器損傷，低氧血癥亦可以造成腦損傷、腦腫脹，即腦水腫，並引發心肌供血不足。心肌缺氧可以導致心肌收縮無力，心臟的泵血功能不足可加重腎臟、肝臟以及腸道的缺血，並且可以造成急性的腎功能衰竭，甚至壞死性小腸結腸炎與肝臟衰竭。如果不及時治療，新生兒急性呼吸窘迫綜合徵則可以造成患兒發生全身多臟器功能衰竭，甚至危及患兒的生命。如果救治方法不當，部分患兒存活以後，低氧可能會造成患兒後期發生智力低下，甚至腦癱，所以新生兒急性呼吸窘迫綜合徵是非常嚴重的危重症。