新生兒呼吸窘迫綜合徵的預防是非常重要的，現不提倡預防性的使用肺泡表面活性物質，但如果是極早的早產兒，出生後半小時之內或在產房之內，就給予嬰兒肺泡表面活性物質，來預防新生兒呼吸窘迫綜合徵的發生或者減輕其程度，多用於產前未使用產前激素預防的新生兒。越早使用，效果越好，最好在嬰兒的呼吸開始前或是在呼吸機正壓呼吸開始之前，從氣管插管內滴入肺泡表面活性物質，可以使複合磷脂在肺內均勻分佈。預防的效果表現在新生兒呼吸窘迫綜合徵的發生率和病死率明顯下降，發病者的情況較沒有預防的患兒是減輕的。此外，新生兒呼吸窘迫綜合徵的其他預防措施如下：

1、產前使用糖皮質激素，促進胎兒的肺發育成熟；

2、經常清除新生兒咽部的黏液，保持氣道的通暢。