對於卵巢囊腫，在臨床一般採用B超檢查，可能更為準確。臨床上卵巢囊腫多選擇B超作為輔助檢測手段，較少對卵巢囊腫進行CT檢測，因為一般B超檢查就足夠診斷，無需再做CT檢查。

CT檢查是將檢查物進行切片檢查，如間隔5mm做一個CT，由數個平面拼湊形成圖像。而B超探查囊腫時能連續觀察，可直觀觀察整個囊腫輪廓，檢查囊腫大小、邊界是否清晰、囊內液體是否清亮，或囊內是否有囊實性改變、囊壁薄厚程度，以及囊腫與周圍組織有無粘連等，一般在B超下均能較清楚地瞭解。