多囊通常不會引起卵巢囊腫，多囊就是B超的表現形式，有不同的意義。多囊可能是指多囊卵巢綜合徵，除了在B超上表現出卵巢有多個小的囊泡外，還有其他的臨床症狀，如月經稀發、不孕、多毛等，是內分泌失調的症候群。還有一種情況就是B超提示有多囊，實際上並不是多囊卵巢綜合徵，而是卵巢的多囊樣表現。除了B超提示卵巢有多囊以外，並沒有多囊卵巢綜合徵的其他表現，如沒有月經失調、沒有不孕等。

卵巢囊腫是新生的腫物，小的卵巢囊腫可能為生理性。在臨床上，生理性卵巢囊腫常見的是黃體囊腫和濾泡囊腫，病理性卵巢囊腫就是卵巢的新生腫物。另外卵巢囊腫也可表現為多房性，即囊腫內部有分隔，表現為多種的形式，這種囊腫需要手術進行治療。