卵巢囊腫是否需要進行手術治療應根據囊腫性質而定，對於多數女性懷孕後出現生理性囊腫，若體積較小通常不必手術治療，可定期隨訪以及應用檢查方法進一步明確。

但對於非孕期實物囊腫，若體積超過4cm且在患者月經結束後隨訪數月仍不見縮小反而增大，或非液性囊腫以及囊腫壁較厚且囊內有乳頭和血流，甚至巧克力囊腫等，均需進行手術治療。

由於部分囊腫在肉眼下或超聲婦科檢查中較難判斷其良惡性，而卵巢囊腫又易出現扭轉、惡變等併發症且較難及時發現。因此，對於直徑較大的真正卵巢囊腫，建議患者儘快進行手術治療。