目前已進入微創時代，若患者經婦科檢查明確為良性囊腫則需進行考慮腹腔鏡手術，通常會在患者腹壁上切5mm左右小手術孔，而在臍部切1cm左右的大手術孔。醫生通常會將切除後囊腫裝入較大取物袋內經由臍處取出。但如果患者已明確診斷卵巢囊腫屬於惡性，則開口可能相對較大，正常情況下切口需超過囊腫直徑以將其完整取出，減少囊腫破裂後導致腫瘤種植和擴散。

因此，通常情況下卵巢囊腫手術創口並不會過大，對於直徑在10cm左右的囊腫均可通過微創手術進行治療。而患者在術前需進行相關檢查以明確卵巢囊腫良、惡性，若囊腫較小且囊內為液體容物，或診斷為畸胎瘤且未出現腹水、囊腫壁較為光滑，此時通常考慮為良性囊腫，可參照上述手術進行操作。